As memórias históricas do Colégio Cenecista São José iniciaram na década de quarenta. Naquela época, Rio Negrinho era um pequeno povoado catarinense. Com a humildade do povo, descendentes de imigrantes, passava por mudanças e novas conquistas, onde a religiosidade sempre esteve presente. A antiga capela de madeira foi demolida para então iniciar a construção da nova igreja. A população, em grande número, tanto adultos e crianças trabalhavam em conjunto.
A paróquia estava confiada aos padres da Congregação do Sagrado Coração de Jesus. Ao lado havia uma casa de madeira onde funcionava uma escola alemã. A educação local contava também, com o grupo escolar Marta Tavares, que registrava a matrícula de aproximadamente 500 alunos.
As indústrias eram destinadas ao ramo madeireiro. A principal era conhecida como "Móveis Cimo", que chegou a ser uma das principais de toda a América Latina, nela trabalhavam em torno de mil operários.
A população em sua grande maioria era pobre, e para proporcionar uma melhor educação e auxílio, o então Vigário, Padre Celso Michels, dirigiu-se a Curitiba para junto das irmãs da Congregação das Irmãs de Chambérry, no bairro do Cajuru, estudarem a prossibilidade da criação de um Jardim de Infância, em Rio Negrinho.
Para iniciar o trabalho educativo, chegaram na cidade em 1947, as primeiras operárias de São José, Madre Joana Maria Greskiro, Irmã Maria Nelly Pereira, Irmã Luiza Inês Dwigan, Madre Imelda e Irmã Umbelina. As mesmas foram recebidas pelo padre Celso Michels, população e autoridades locais.
As irmãs iniciaram as atividades em uma casa, onde era sede da Sociedade dos Cantores. Casa esta onde se localizava o antigo Banco do Brasil, destruído por um incêndio no ano de 2000.
As matrículas foram muitas, não havia diferença entre pobre e rico. As Irmãs com dedicação, a serviço da educação, conquistaram a estima de todos. O número de alunos aumentou e foi necessário criar também o curso primário. Ajeitou-se inicialmente uma sala, no entanto seria provisório. As Irmãs juntamente com o vigário, concluíram ser urgente a construção do colégio definitivo. Este deveria ser construído em um terreno comprado pelas Irmãs em 1947, porém não era apropriado. Foi então que o proprietário Senhor Carlos Weber doou generosamente um terreno próximo a Igreja.
O trabalho da construção iniciou-se em 1950 e foi bem organizado. O padre Celso Michels, as Irmãs, bem como a comunidade, dedicaram-se muito para que o projeto fosse concluído.
Enfim, em 17 de fevereiro de 1952, o novo prédio do Educandário Santa Terezinha foi inaugurado com muita alegria e orgulho.
Até o final de 1957, o Educandário oferecia os cursos de Jardim de Infância e Primário. Foi então necessário criar o curso ginasial.
O Padre Luiz Gonzaga Steiner, terceiro vigário da Paróquia Santo Antônio de Pádua de Rio Negrinho (1957-1966) foi o fundador do ginásio São José, tendo o apoio direto da comunidade.
Em 1957, reunido com grande número de interessados, discutiu-se a possibilidade da criação de um Ginásio Gratuito em Rio Negrinho. Esclareceu que a Campanha do Ginasiano Pobre, fundada pelo Professor Felipe Tiago Gomes, em 1943, em Recife, era mantenedora de Ginásios. Este conhecimento veio através de uma notícia publicada num jornal sobre sua fundação no Nordeste do Brasil. Tempos depois, esta instituição passou a ser denominada de Campanha Nacional de Educandários Gratuitos-CNEG.
Convocada a Assembléia Geral para a constituição do Setor Local da CNEG, em 29 de maio de 1957, no Salão Nobre do Educandário Santa Terezinha, com a presença de 106 pessoas, realizou-se a eleição da 1ª Diretoria da CNEG em Rio Negrinho, assim constituída: Presidente: Pe. Aloísio Steiner, Vice-Presidente: Urbano Murara, Secretário Geral: Arnaldo de Almeida Oliveira, 1º Secretário: Rodolfo Jablonski, 2º Secretário: Euclides Ribeiro, 1º Tesoureiro: Hains Hauffe, 2º Tesoureiro: Alfredo Grossl, Conselho Fiscal: João Evaristo Bauer, Milton Zipperer, Luiz Neidert, Suplentes do Conselho Fiscal: Álvaro Spitzner, Jorge Zipperer Júnior e Paulo Helmuth Grambeck.
A CNEG em Rio Negrinho consolidou-se graças ao dinamismo de seu idealizador e sobre tudo de seus companheiros de jornada.
De início, tudo muito difícil, mas o amor pela causa Cenecista foi além, conseguindo maior número de adeptos. Os membros da Diretoria iam de casa em casa, com listas para novas adesões.
Em março de 1958, dezenas de matrículas foram realizadas no curso de admissão ao Ginásio, para ingresso do 1º ciclo, do Ginásio São José. Em 1961 o Ginásio formava a 1ª turma.
Problemas e dificuldades, a cada ano, faziam parte da admissão do Colégio, como: recursos financeiros insuficientes, carência de profissionais e necessidade de ampliação do espaço físico.
Para reforçar o quadro de profissionais o Padre Luiz Gonzaga Steiner, contratou professores da cidade de Curitiba, entre eles o professor Pedro Henrique Berkenbrock que compreendeu o ideal e passou a dedicar-se pela obra. Em 1965, foi empossado como Diretor do Ginásio, que iniciava uma nova época histórica.
Mesmo sobre nova direção e tendo saído de Rio Negrinho, por várias vezes, Padre Luiz Gonzaga Steiner interveio para ajudar, orientar e sugerir, acompanhando os passos do Colégio Cenecista São José.
No mesmo prédio funcionava o Ginásio São José da CNEG e o Educandário Santa Terezinha (1ª à 4ª Série) de propriedade das Irmãs. Em 1973 de comum acordo, CNEG e Irmãs, o Educandário passou a ser administrado pelo Ginásio São José.
Em 1974 o professor Pedrinho liderou campanha para a aquisição do prédio junto às Irmãs.
Em 1977, compôs-se o Colégio Cenecista São José, por decreto Federal, reunindo o Ginásio, o Educandário e a escola Técnica Comercial, esta de iniciativa privada, todos funcionando no mesmo prédio, sobre a direção do professor Pedro.
Sua dedicação, capacidade diplomática e amor pela profissão tornaram-no um dos diretores mais conhecidos e dinâmicos.
Em sua administração também construiu o 1º Ginásio de Esportes de Rio Negrinho, e com o nome homenageou aquele que conseguiu todo o dinheiro para estas obras e é filho do político Luiz de Vasconcellos, que tanto fez pela região.
Após a morte do saudoso professor Pedrinho, assume por alguns meses a direção, sua esposa Marília Berkenbrock, sendo que em 1982 assumiu a direção e administração o professor Darci José Klaus.
Em sua administração introduziu-se toda uma nova visão de avaliação de ensino, aprendizagem, de cursos diversificados e entre eles, um deixou história, o Magistério a Nível Médio. Fez-se convênio com o curso Positivo de Curitiba e os professores receberam informações de como trabalhar com este novo material.
Nesta gestão, viabilizou-se recursos para executar o projeto de construção e ampliação da Pré- Escola.
Era esta uma necessidade que se fazia sentir ao longo dos anos. Foi isso, inclusive, que deu mais credibilidade ao Colégio Cenecista São José perante a sociedade.
A tragédia das enchentes nos anos de 1983 e 1992 que assolou nossa cidade, também afetou nosso colégio e deixou marcas profundas com a perda de documentos e registros importantes sobre a história.
O Colégio ainda se projetou a nível nacional e mesmo a nível internacional ao tornar-se bi-campeão nacional, por duas vezes consecutivas, no Concurso de Bandas e Fanfarras realizado em São Paulo (1992 e 1993) e em 1995 o Colégio Cenecista São José foi convidado a apresentar-se no Chile com sua banda.
O professor Klaus permaneceu até 2000 na direção do Colégio Cenecista São José, quando em agosto de 2000 assumiu a Direção Administrativa, o professor Adriano de Sales Coelho, onde permaneceu na direção até dezembro de 2008, em dezembro de 2008 assume a direção professor Luciano Alves, onde permancer na direção até abril de 2010, onde quem assume a direção a partir daí a professora Salete de Oliveira Spitzner.
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